2016 02 09

TogoAnnotator データモデル設計

• Provenance ontologyのデータモデルを採用
• 赤字のデータモデルを利用
• taxonomy_id, database xref のpredicate および resource URIの体系が異なるので、TogoAnnotatorでpredicateを定義した。
• • tga:in_taxon
• • tga:reference
• , のURIのID体系はidentifiers.orgを利用するとよさそう
• prov:wasDerivedFrom のリソースURIをどうするか 【Todo】→ ブランクノードにしておき、必要に応じて設計する
• のリソースURIをどうするか【Todo】→ :UniProt, :DDBJ, :RefSeq, :EnsEMBL

UniProt データモデル（参考）

参考リンク

• http://www.slideshare.net/satyasanket/provenance-analysis-and-rdf-query-processing-w3c-prov-for-data-quality-and-trust-53927335

次回

• TogoAnnotator辞書開発
• • 設計したデータモデルでRDFを生成する
• • Before AfterのセットをSPARQLを取り出す
• DDBJ Annotated Sequence Validator 試作