Link集　　

植物のゲノム解析関連

• 植物の比較ゲノムに便利なサイト 　- PGDD
• 遺伝子の並び方の比較 (http://chibba.agtec.uga.edu/duplication/index/locus)
• VISUALIZING SYNTENIC BLOCKS 植物種ごとにプロット

---

イネの解析関連

• OryzaGenome

• Display imputed sequences of 446 O. rufipogon accessions.

• 染色体の位置を指定し、その領域のSNPをダウンロード可能

• TASUKE Rice 50 genome browser

  • 50品種のSNP情報を利用可能
  • Nipponbare referenceと、Kasalath referenceの両方を利用可能
  • FASTA形式、csv形式でダウンロード可能

• RAPDB variant call pipeline

--

sorghum QTL解析関連

• CSGRqtl
  • Comparative Maps
  • a comparative QTL database

---

配列解析関連

• web上で塩基配列の翻訳や分子量の推定
• The Sequence Manipulation Suite

解析のためのメモとして利用しております。