MRI-data-processing

Разработка программного обеспечения предобработка сырых данных с магнитнорезонансной томографии

Windows

0. Скачайте Python, версия Python должна быть 3.11.3 или выше
1. Клонируйте репозиторий

git clone https://github.com/IT-Continue/MRI-data-processing.git

или скачайте архивом

2. Зайдите в папку с проектом

cd MRI-data-processing

3. Создайте виртуальное окружение

# Сначала установим пакет virtualenv
pip install virtualenv

# Затем создаём наше виртуальное окружение 
virtualenv venv

4. Активируйте виртуальное окружение

venv\scripts\activate

5. Запустите init.py

.\init.py

6. Скачайте необходимые библиотеки

pip install -r requirements.txt

7. Положите в директорию raw_data файлы: schem.npy и shuffeld_kspace.npy
8. Запустите скрипт raw_to_image.py, в папке output должен появится файл output.png