fix issues

xadupre · xadupre · commit a999e560a2de · 2025-03-05T23:00:41.000+01:00
diff --git a/.github/workflows/documentation.yml b/.github/workflows/documentation.yml
@@ -86,6 +86,6 @@ jobs:
             exit 1
           fi
 
-      - uses: actions/upload-artifact@v3
+      - uses: actions/upload-artifact@v4
         with:
           path: ./dist/html/**
diff --git a/.github/workflows/wheels-any.yml b/.github/workflows/wheels-any.yml
@@ -24,6 +24,6 @@ jobs:
       - name: build wheel
         run: python -m pip wheel .
 
-      - uses: actions/upload-artifact@v3
+      - uses: actions/upload-artifact@v4
         with:
           path: ./mlstatpy*.whl
diff --git a/CHANGELOGS.rst b/CHANGELOGS.rst
@@ -5,7 +5,7 @@ Change Logs
 +++++
 
 0.4.0
-=====
++++++
 
 * :pr:`42`: quantization
 * :pr:`39`: refactoring, use black, better documentation
@@ -28,4 +28,3 @@ Change Logs
 * :pr:`9`: fix unittest on wikipedia_dump after a change on wikipedia website (2018-04-01)
 * :pr:`4`: implémentation la complétion en C++ (2016-09-25)
 * :pr:`1`: ajouter les petits exposés finance... (2016-06-29)
-
diff --git a/_doc/api/data.rst b/_doc/api/data.rst
@@ -2,10 +2,6 @@
 Source de données
 =================
 
-.. contents::
-    :local:
-    :depth: 2
-
 Wikipédia
 +++++++++
 
diff --git a/_doc/api/graph.rst b/_doc/api/graph.rst
@@ -2,10 +2,6 @@
 Graphes
 =======
 
-.. contents::
-    :local:
-    :depth: 2
-
 Distance
 ++++++++
 
diff --git a/_doc/api/image.rst b/_doc/api/image.rst
@@ -2,10 +2,6 @@
 Image
 =====
 
-.. contents::
-    :local:
-    :depth: 2
-
 Conversion
 ++++++++++
 
diff --git a/_doc/api/ml.rst b/_doc/api/ml.rst
@@ -2,10 +2,6 @@
 Machine Learning
 ================
 
-.. contents::
-    :local:
-    :depth: 2
-
 Matrices
 ++++++++
 
diff --git a/_doc/api/optim.rst b/_doc/api/optim.rst
@@ -2,10 +2,6 @@
 Optimisation
 ================
 
-.. contents::
-    :local:
-    :depth: 2
-
 Gradient
 ++++++++
 
diff --git a/_doc/api/text.rst b/_doc/api/text.rst
@@ -1,10 +1,6 @@
 Traitement du langage naturel
 =============================
 
-.. contents::
-    :local:
-    :depth: 2
-
 Complétion
 ++++++++++
 
diff --git a/_doc/c_algo/gest.rst b/_doc/c_algo/gest.rst
@@ -5,9 +5,6 @@
 Détection de segments
 =====================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 L'idée
 ======
 
diff --git a/_doc/c_algo/graph_distance.rst b/_doc/c_algo/graph_distance.rst
@@ -13,9 +13,6 @@ One of the solution is the
 a better solution is described in [Blondel2004]_. You can also read
 `Graph similarity <http://www.cs.uoi.gr/~pvassil/downloads/GraphDistance/LauraZager.pdf>`_.
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Definitions
 ===========
 
diff --git a/_doc/c_clus/gauss_mixture.rst b/_doc/c_clus/gauss_mixture.rst
@@ -5,9 +5,6 @@
 Mélange de lois normales
 ========================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Algorithme EM
 =============
 
diff --git a/_doc/c_clus/kmeans.rst b/_doc/c_clus/kmeans.rst
@@ -5,9 +5,6 @@
 k-means
 =======
 
-.. contents::
-    :local:
-
 *Dénomination française : algorithme des centres mobiles.*
 
 .. index:: centres mobiles, k-means, variance intra-classe, inertie
diff --git a/_doc/c_clus/kohonen.rst b/_doc/c_clus/kohonen.rst
@@ -5,9 +5,6 @@
 Carte de Kohonen
 ================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Principe
 ========
 
diff --git a/_doc/c_garden/file_dattente.rst b/_doc/c_garden/file_dattente.rst
@@ -5,9 +5,6 @@ File d'attente, un petit exemple
 
 *Psychokinèse, les ampoules grillent à distance*
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Petite histoire
 ===============
 
diff --git a/_doc/c_garden/quantization.rst b/_doc/c_garden/quantization.rst
@@ -5,9 +5,6 @@
 Quantization
 ============
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Un problème simple
 ==================
 
diff --git a/_doc/c_garden/strategie_avec_alea.rst b/_doc/c_garden/strategie_avec_alea.rst
@@ -5,9 +5,6 @@
 Optimisation avec données aléatoires
 ====================================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Un problème simple
 ==================
 
diff --git a/_doc/c_metric/pvalues.rst b/_doc/c_metric/pvalues.rst
@@ -5,9 +5,6 @@
 Confidence Interval and p-Value
 ===============================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 This document explains the relationship between p-value and confidence intervals.
 It goes on with the specific case of a binamial law. Assuming we want to determine
 whether or not two binomial laws are significantly different, how many observations
diff --git a/_doc/c_metric/roc.rst b/_doc/c_metric/roc.rst
@@ -5,9 +5,6 @@
 Courbe ROC
 ==========
 
-.. contents::
-    :local:
-
 .. index:: ROC
 
 Ce document introduit la `courbe ROC
diff --git a/_doc/c_ml/l1l2.rst b/_doc/c_ml/l1l2.rst
@@ -24,9 +24,6 @@ transposée dans l'espace initial.
 Une autre astuce consiste à imposer une contrainte supplémentaire sur
 le poids des coefficients de la régression, le plus souvent en les pénalisant.
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Réduction de dimension
 ======================
 
diff --git a/_doc/c_ml/lr_trees.rst b/_doc/c_ml/lr_trees.rst
@@ -12,9 +12,6 @@ logistiques à mi-chemin entre les arbres de décisions
 et les réseaux de neurones. Dans un premier temps, on s'intéresse
 uniquement à une classification binaire.
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Parallèle entre un neurone et une régression logistique
 =======================================================
 
diff --git a/_doc/c_ml/lr_voronoi.rst b/_doc/c_ml/lr_voronoi.rst
@@ -13,9 +13,6 @@ qui allie la régression logistique et les clustering type
 :ref:`l-k-means`. Le point de départ est une conjecture :
 les régions créées par une régression logistique sont convexes.
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Diagramme de Voronoï
 ====================
 
diff --git a/_doc/c_ml/missing_values_mf.rst b/_doc/c_ml/missing_values_mf.rst
@@ -10,9 +10,6 @@ Cette méthode est utilisée dans le cadre de la recommandation de produits
 à des utilisateurs.
 Lire également [Acara2011]_, [Gupta2010]_.
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Factorisation de matrices et rang
 =================================
 
diff --git a/_doc/c_ml/piecewise.rst b/_doc/c_ml/piecewise.rst
@@ -22,9 +22,6 @@ n'est pas de le faire mais de le faire efficacement.
 Et pour comprendre là où je veux vous emmener, il faudra
 un peu de mathématiques.
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Une implémentation de ce type de méthode est proposée
 dans la pull request `Model trees (M5P and co)
 <https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/issues/13106>`_
diff --git a/_doc/c_ml/regression_quantile.rst b/_doc/c_ml/regression_quantile.rst
@@ -9,9 +9,6 @@ La régression quantile est moins sensible aux points aberrants.
 Elle peut être définie comme une régression avec une norme
 *L1* (une valeur absolue).
 
-.. contents::
-    :local:
-
 .. _l-reg-quantile-demo:
 
 Médiane et valeur absolue
diff --git a/_doc/c_ml/rn/rn_4_densite.rst b/_doc/c_ml/rn/rn_4_densite.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Démonstration du théorème de la densité des réseaux de neurones
 ===============================================================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 .. _rn_enonce_probleme_regression:
 
 Formulation du problème de la régression
diff --git a/_doc/c_ml/rn/rn_5_newton.rst b/_doc/c_ml/rn/rn_5_newton.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Descente de gradient
 ====================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Lorsqu'un problème d'optimisation n'est pas soluble de manière déterministe,
 il existe des algorithmes permettant de trouver une solution approchée
 à condition toutefois que la fonction à maximiser ou minimiser soit dérivable,
diff --git a/_doc/c_ml/rn/rn_6_apprentissage.rst b/_doc/c_ml/rn/rn_6_apprentissage.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Apprentissage d'un réseau de neurones
 =====================================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Le terme apprentissage est encore inspiré de la biologie et se traduit
 par la minimisation de la fonction :eq:`equation_fonction_erreur_g` où
 :math:`f` est un réseau de neurone défini par un :ref:`perceptron <rn_definition_perpception_1>`.
diff --git a/_doc/c_ml/rn/rn_7_clas2.rst b/_doc/c_ml/rn/rn_7_clas2.rst
@@ -4,9 +4,6 @@
 Classification
 ==============
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Vraisemblance d'un échantillon de variable suivant une loi multinomiale
 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
 
diff --git a/_doc/c_ml/rn/rn_8_prol.rst b/_doc/c_ml/rn/rn_8_prol.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Prolongements
 =============
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Base d'apprentissage et base de test
 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++
 
diff --git a/_doc/c_ml/rn/rn_9_auto.rst b/_doc/c_ml/rn/rn_9_auto.rst
@@ -4,9 +4,6 @@
 Analyse en composantes principales (ACP) et Auto Encoders
 =========================================================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 .. index:: ACP
 
 Cet algorithme est proposé dans [Song1997]_.
diff --git a/_doc/c_nlp/completion_digression.rst b/_doc/c_nlp/completion_digression.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Digressions
 ===========
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Synonymes, Contexte
 +++++++++++++++++++
 
diff --git a/_doc/c_nlp/completion_fausse.rst b/_doc/c_nlp/completion_fausse.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Fausses idées reçues
 ====================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Il faut trier les complétions par fréquence décroissante
 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
 
diff --git a/_doc/c_nlp/completion_formalisation.rst b/_doc/c_nlp/completion_formalisation.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Formalisation
 =============
 
-.. contents::
-    :local:
-
 .. _l-completion-optim:
 
 Problème d'optimisation
diff --git a/_doc/c_nlp/completion_implementation.rst b/_doc/c_nlp/completion_implementation.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Implémentation
 ==============
 
-.. contents::
-    :local:
-
 .. _trie: https://fr.wikipedia.org/wiki/Trie_(informatique)
 
 J'allais vous raconter en détail ce qu'est un trie_ et le paragraphe suivant
diff --git a/_doc/c_nlp/completion_metrique.rst b/_doc/c_nlp/completion_metrique.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Nouvelle métrique
 =================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Intuitions
 ++++++++++
 
diff --git a/_doc/c_nlp/completion_optimisation.rst b/_doc/c_nlp/completion_optimisation.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Problème d'optimisation
 =======================
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Enoncé 1
 ++++++++
 
diff --git a/_doc/c_nlp/completion_propriete.rst b/_doc/c_nlp/completion_propriete.rst
@@ -6,9 +6,6 @@ On s'intéresse principalement à la métrique :math:`M'` définie par
 Dynamic Minimum Keystroke :eq:`completion-metric2` mais les résultats
 seront étendues aux autres quand cela est possible.
 
-.. contents::
-    :local:
-
 Calcul pour une complétion
 ++++++++++++++++++++++++++
 
diff --git a/_doc/defthe_index.rst b/_doc/defthe_index.rst
@@ -2,9 +2,6 @@
 Listes des définitions et théorèmes
 ===================================
 
-.. contents:: .
-    :depth: 2
-
 Corollaires
 +++++++++++
 
diff --git a/_doc/examples/plot_logistic_decision.py b/_doc/examples/plot_logistic_decision.py
diff --git a/_doc/i_ex.rst b/_doc/i_ex.rst
diff --git a/_doc/index.rst b/_doc/index.rst
