diff --git a/build.sh b/build.sh index c2f4ab0..ac8e2ae 100755 --- a/build.sh +++ b/build.sh @@ -20,5 +20,5 @@ tar -xvf cellorganizer-binaries.tgz && \ rm cellorganizer-binaries.tgz #docker build --no-cache -t icaoberg/cellorganizer-jupyter:latest . -docker build -t murphylab/cellorganizer-jupyter:latest . -docker tag murphylab/cellorganizer-jupyter:latest murphylab/cellorganizer-jupyter:mmbios2021 +docker build -t murphylab/cellorganizer-jupyter:dev . +docker tag murphylab/cellorganizer-jupyter:dev murphylab/cellorganizer-jupyter:dev diff --git a/cellorganizer-python b/cellorganizer-python index 395f635..105b9c9 160000 --- a/cellorganizer-python +++ b/cellorganizer-python @@ -1 +1 @@ -Subproject commit 395f6359fea361a2564eb6c61b89401dea346d84 +Subproject commit 105b9c9a383178742a7dadc865502644d3a1f5b3 diff --git a/push.sh b/push.sh index ae4d0cf..13d38db 100755 --- a/push.sh +++ b/push.sh @@ -1,5 +1,5 @@ #!/bin/bash docker push murphylab/cellorganizer-jupyter:latest -docker push murphylab/cellorganizer-jupyter:v2.9.1 -docker push murphylab/cellorganizer-jupyter:mmbios2021 +docker push murphylab/cellorganizer-jupyter:v2.9.3 +docker push murphylab/cellorganizer-jupyter:mmbios2022 diff --git a/run.sh b/run.sh index 5f09ae0..01c9193 100755 --- a/run.sh +++ b/run.sh @@ -1,21 +1,21 @@ #!/bin/bash -if [ ! -d ~/Desktop/mmbios2021 ]; then +if [ ! -d ~/Desktop/mmbios2022 ]; then DIRECTORY=$(pwd) #################################################################################################### # icaoberg - this creates temporary folder on Desktop - mkdir -p ~/Desktop/mmbios2021 - chmod a+rwx -R ~/Desktop/mmbios2021 - cd ~/Desktop/mmbios2021 + mkdir -p ~/Desktop/mmbios2022 + chmod a+rwx -R ~/Desktop/mmbios2022 + cd ~/Desktop/mmbios2022 #################################################################################################### cd $DIRECTORY fi ############################################################################################################ docker run --rm -p 8888:8888 \ - -v ~/Desktop/mmbios2021:/home/murphylab/cellorganizer/local \ - --memory="4g" \ - --cpus=2 \ + -v ~/Desktop/mmbios2022:/home/murphylab/cellorganizer/local \ + --memory="12g" \ + --cpus=6 \ -e JUPYTER_LAB_ENABLE=yes \ murphylab/cellorganizer-jupyter ############################################################################################################